Jawatan Popular

Pilihan Editor - 2019

KeyGenes boleh meramalkan identiti masa depan sel janin janin manusia

Anonim

Satu gambaran aktiviti gen kini adalah semua yang diperlukan untuk menentukan jenis organ atau tisu yang mana sekumpulan sel stem janin akhirnya akan menjadi. Algoritma yang dibangunkan oleh pasukan saintis Belanda menjadikannya sesuai untuk menandingi apa yang berlaku di dalam sel stem yang tidak matang untuk dikenali dengan ekspresi gen sel janin manusia, dengan itu mengenal pasti apa yang sel stem mempunyai potensi untuk menjadi. Platform yang digelar KeyGenes dan membentangkan 28 Mei di Stem Cell Reports, juga boleh membuktikan berguna untuk menguji kualiti pemindahan stem sel yang terdiri daripada sel-sel yang tidak dibezakan.

iklan


"Salah satu perkara paling sukar dalam biologi sel stem ialah menentukan apa yang telah menjadikan sel-sel anda menggunakan kaedah pembezaan tertentu, " kata pengkaji kanan kajian Susana Chuva de Sousa Lopes dari Pusat Perubatan Universiti Leiden di Belanda. "Kami berfikir bahawa KeyGenes dapat membantu kami membangunkan protokol pembezaan yang membawa kepada sel-sel membentuk yang menyerupai mereka dalam rakan kongsi vivo jauh lebih dekat."

CellNet, sebuah platform setanding untuk memetakan nasib sel stem, telah diterbitkan oleh penyelidik Boston musim panas lepas. Perbezaannya adalah CellNet membantu menyimpulkan kualiti prosedur yang digunakan untuk membezakan tisu dewasa manusia dengan membandingkan tisu ke data microarray (ujian yang melihat gen yang dimatikan atau dimatikan). KeyGenes didasarkan pada ekspresi gen dan mengintegrasikan data dari kedua-dua tisu janin dan dewasa manusia untuk menentukan "skor identiti" untuk sel yang dibezakan.

"Dengan mengumpul data yang luas mengenai ekspresi gen semasa pembangunan janin manusia (pada peringkat yang berbeza tetapi juga beberapa organ), KeyGenes membolehkan derivatif sel stem manusia dikenalpasti dan diberi setara dengan 'usia', " kata pengarang penulis Leiden University, Christine Mummery, seorang ahli lembaga Persatuan Antarabangsa untuk Penyelidikan Stem Cell.

Di klinik itu, para penyelidik percaya bahawa alat itu boleh membantu dalam kes-kes di mana perkembangan manusia menjadi salah, dan memungkinkan untuk mengenal pasti tisu-tisu yang terdapat dalam jumlah yang berlebihan atau tidak berada di tempat yang betul. Platform seperti Keygen juga boleh membolehkan sel stem pesakit lebih tepat dibezakan untuk tujuan pemindahan atau pengujian dadah.

Dalam makmal, KeyGenes telah membawa kepada wawasan dalam gen yang menentukan nasib sel. Gen-gen yang dikenalpasti selalu merupakan campuran dari faktor-faktor transkripsi (molekul yang menentukan gen yang dinyatakan) serta yang berkaitan dengan perekatan dan bentuk sel. "Di samping itu, beberapa KeyGenes yang dikenal pasti adalah RNA tidak lama pengekodan, menggambarkan dan mengesahkan peranan yang semakin penting untuk kelas molekul ini, " kata Lopes.

Lebih banyak jenis sel dan organ telah diuji dan makmalnya membuat KeyGenes secara terbuka tersedia kepada komuniti saintifik supaya platform boleh digunakan dan diperluaskan. Dia bertujuan untuk alat ini untuk memasukkan set data epigenetik juga untuk memahami sama ada ingatan epigenetik dari organ asal tetap dan sama ada yang mempengaruhi kapasiti sel untuk membezakan jenis sel tertentu.

iklan



Sumber Cerita:

Bahan yang disediakan oleh Cell Press . Nota: Kandungan mungkin diedit untuk gaya dan panjang.


Rujukan jurnal :

  1. Patrick Cahan, Hu Li, Samantha A. Morris, Edroaldo Lummertz da Rocha, George Q. Daley, James J. Collins. CellNet: Biologi Rangkaian yang Dipohon kepada Kejuruteraan Stem Cell . Sel, 2014; 158 (4): 903 DOI: 10.1016 / j.cell.2014.07.020
  2. Roost et al. KeyGenes, alat untuk membezakan pembezaan tisu menggunakan atlas transkrip janin manusia . Laporan Stem Cell, Mei 2015 DOI: 10.1016 / j.stemcr.2015.05.002