Jawatan Popular

Pilihan Editor - 2019

Pangkalan data menjejaki kesan sampingan toksik farmaseutikal

Anonim

Kadang-kadang penawar boleh lebih buruk daripada penyakit ini. Ubat farmaseutikal dikenali kerana kesan sampingannya yang berpotensi, dan aspek penting dalam perubatan peribadi adalah untuk menyesuaikan terapi kepada individu untuk mengurangkan peluang kejadian buruk. Kini penyelidik dari North Carolina State University telah mengemaskini pangkalan data toksikologi yang luas supaya dapat digunakan untuk mengesan maklumat mengenai ubat terapeutik dan kesan toksik yang tidak disengajakan mereka.

iklan


"Sains alam sekitar benar-benar berkongsi matlamat bersama dengan pembuat dadah: untuk meningkatkan ramalan ketoksikan kimia, " kata Dr Allan Peter Davis, pengarang utama kertas kerja dan pengurus projek biokurasi Database Toksikogenik Perbandingan (CTD) dalam Jabatan Sains Biologi Negeri NC.

Sastera saintifik mengandungi maklumat yang luas mengenai kesan buruk ubat terapeutik. Tetapi mengumpul, mengatur dan memahami maklumat yang diterbitkan adalah tugas yang menakutkan. Pasukan CTD NC State, yang secara sejarah memberi tumpuan kepada bahan kimia alam sekitar, membaca dan mengodkan lebih daripada 88, 000 kertas saintifik untuk usaha ini.

Ia memerlukan satu tahun untuk mengambil maklumat daripada 88, 000 kertas mengenai ubat terapeutik dan penglibatan mereka dalam titik endapan toksik, seperti hipertensi, sawan, kegagalan buah pinggang dan penyakit hati. "Projek ini dengan cepat menambah banyak data baru yang melengkapkan ketoksikan alam sekitar, " kata Davis.

Hasilnya termasuk lebih daripada 250, 000 kenyataan yang dikumpulkan daripada artikel saintifik tujuh puluh tahun. Meletakkan data ke dalam rangka kerja CTD membantu penyiasat membangun dan menguji hipotesis tentang bagaimana dadah mungkin menyebabkan peristiwa buruk.

"Mengekodkan maklumat dalam format berstruktur adalah kunci, " kata Davis. "Ini membolehkan ia digabungkan dengan data lain untuk membuat ramalan baru." Misalnya, ubat bortezomib digunakan untuk merawat beberapa jenis kanser, tetapi ia juga menyebabkan kerosakan saraf yang tidak diingini pada beberapa pesakit. Dengan menghubungkan data, CTD dapat menyambungkan titik-titik dan mencari gen yang mungkin penting untuk menyambung dadah dan kemungkinan kerosakan saraf.

"Penyiasat kini boleh menguji dan mengesahkan gen yang mungkin kritikal terhadap peristiwa yang disebabkan oleh dadah, " jelas Davis. "Ini boleh berguna dalam pesakit ujian gen untuk menyesuaikan ubat yang betul atau ia boleh membantu merangka terapeutik masa depan dengan menyedarkan para penyelidik keselamatan untuk mengelakkan laluan dan potensi hasil toksik."

Kumpulan CTD juga merancang modul fenotip baru. Dalam konteks ini, fenotip adalah peristiwa yang berlaku dalam sel atau sistem sebelum ketoksikan atau penyakit penuh diakui di peringkat klinikal. Dadah boleh menjejaskan fenotip serta penyakit. Pengkomputeran bebas ubat-ubatan dan interaksi ubat-fenotip bebas dari kesusasteraan dan kemudian menyimpannya dalam pangkalan data yang sama membolehkan sistem untuk menyambungkan fenotip tertentu kepada penyakit, berdasarkan ubat-ubatan mereka yang dikongsi. Sambungan ini membolehkan para saintis menyelesaikan, dan akhirnya menghalang, bagaimana bahan kimia - dari alam sekitar atau dari kabinet ubat - menyebabkan ketoksikan.

iklan



Sumber Cerita:

Bahan yang disediakan oleh North Carolina State University . Nota: Kandungan mungkin diedit untuk gaya dan panjang.


Rujukan jurnal :

  1. Thomas Wiegers et al. Kerjasama CTD-Pfizer: kurungan manual 88, 000 artikel saintifik teks yang ditanam untuk interaksi penyakit-ubat dan ubat-fenotip . Pangkalan Data, Disember 2013