Jawatan Popular

Pilihan Editor - 2019

Analisis interaksi protein kompleks

Anonim

Komposisi kompleks protein fungsian tertentu dalam persekitaran selular mereka kini dapat dianalisis dengan resolusi yang belum pernah terjadi sebelumnya. Pasukan yang diketuai oleh ketua kumpulan muda Dr Julien Béthune di Pusat Biokimia Universiti Heidelberg telah mengembangkan satu teknik baru yang membolehkan saintis mengatasi halangan lama dalam biologi sel molekul. Kaedah yang dipanggil "split-BioID" membolehkan mereka menganalisis kompleks protein yang bergantung kepada konteks yang tidak dapat dikenal pasti sebelum ini. Keputusan penyelidikan mereka diterbitkan dalam jurnal Nature Communications .

iklan


Genom organisma hidup mengkodekan puluhan ribu protein yang melaksanakan kebanyakan fungsi selular. Untuk memenuhi tugas mereka, protein mesti berinteraksi untuk membentuk perhimpunan macromolecular besar. Pengenalpastian interaksi protein-protein dalam kompleks tersebut telah menjadi tugas penting dalam bidang biologi sel molekul. Tetapi cabaran utama datang dari sifat dinamik perhimpunan ini. "Biasanya, protein tunggal adalah sebahagian dari beberapa kompleks yang berbeza dan sering bertindih yang mengubah suai mengikut konteks selular dan fungsi fisiologi yang akan diberikan, " jelas Dr Béthune. "Setakat ini, kekurangan teknik analisis dengan resolusi yang mencukupi menghalang tugasan interaksi protein-protein mudah untuk kompleks berfungsi khusus."

Dalam penyelidikan mereka, saintis menggabungkan dua pendekatan yang sedia ada: satu ujian yang dipanggil BioID untuk mengenal pasti kemungkinan interaksi protein-ke-protein dengan teknik pelabelan dan konsep "Assay-Fragments Complementation Assay" (PCA), sebuah kaedah untuk mengesahkan interaksi antara dua protein. "Berbanding dengan kaedah konvensional, novel 'split-BioID' memberikan resolusi spatio-temporal yang luar biasa yang membolehkan analisis mudah kompleks komposit bergantung pada konteks, " menekankan Isabel Schopp, calon PhD dalam kumpulan penyelidikan Béthune dan pengarang utama kajian . Para penyelidik kini berharap untuk mendapatkan pemahaman yang lebih baik mengenai bagaimana sel-sel bertindak balas secara dinamik dengan persekitaran mereka.

iklan



Sumber Cerita:

Bahan yang disediakan oleh Heidelberg, Universität . Nota: Kandungan mungkin diedit untuk gaya dan panjang.


Rujukan jurnal :

  1. Isabel Myriam Schopp, Cinthia Claudia Amaya Ramirez, Jerneja Debeljak, Elisa Kreibich, Merle Skribbe, Klemens Wild, Julien Béthune. Split-BioID pendekatan proteomik bersyarat untuk memantau komposisi kompleks protein spatiotemporalis yang ditetapkan . Komunikasi Alam, 2017; 8: 15690 DOI: 10.1038 / ncomms15690